En 1966 abrió su propio estudio de fotografía, principalmente tomando fotos de moda y publicidad para pequeñas revistas femeninas. Rápidamente gano respeto por su trabajo en París, comenzó a exponer en las galerías locales y finalmente publicó su primer libro. En 1995, Ommer cambió drásticamente el foco y decidió emprender un proyecto diferente a cualquier cosa que había hecho antes. Como desafío personal, se propuso al año siguiente documentar todo tipo de familias en todos los continentes a principios del milenio. Con un Land Rover, una cámara Rolleiflex, un estudio portátil, un asistente, muchos mapas, muchas guías, pero sin un teléfono, un sistema de GPS, piezas de repuesto o un reloj, Ommer visitó 130 países en los siguientes cuatro años, entrevistando y fotografiando más de 1000 Familias.
Volviendo a París en 2000, Ommer tenía una colección de 1251 fotografías que ilustran la "familia", en su estado y diversidad actual. Ommer había cumplido y superado el tremendo desafío que él mismo había planteado cuatro años antes. Había realizado su sueño con una colección de fotografías que demostraban, a pesar de las diferencias en cultura, geografía, idioma o religión, que la familia sigue siendo una de las instituciones más notables y universales para los seres humanos en todo el mundo.
Taschen publicó el catalogo "1000 Familias" en 2000, cuando las fotografías fueron expuestas por primera vez al público en Colonia, Alemania, en septiembre en Photokina 2000. Desde entonces, la exposición ha recorrido el mundo y ha recibido elogios por el alcance y la belleza de la Fotografías, y su simple mensaje de comunalidad. En 2002, le fue concedida una membresia honoraria de la Royal Photographic Society por el impacto en la fotografia del trabajo de toda su vida.
Tiene editados una buena cantidad de publicaciones, todas con muy buena critica y comercialmente exitosas, Photedition 2 1980, Exotic 1983, Calendario Pirelli 1984, Black ladies 1987 y 1995, Erotic Photographs 1988, Uwe Ommer 1990, Noumia, 1994, Asian ladies 2000, 1000 Families: das Familienalbum des Planeten Erde 2002, Transit: in 1424 Tagen um die Welt 2006, Do It Yourself, with Renaud Marchand 2007.